Ühingu kõrgeimaks juhtimisorganiks on liikmete üldkoosolek, mille kutsub kokku juhatus üks kord aastas.
Üldkoosolekul valitakse kaheks aastaks kolme kuni kaheksaliikmeline juhatus, kes tegutsedes ühingu jaoks kõige otstarbekamal viisil, esindab ja juhib seda. Juhatus valib juhatuse liikmete hulgast juhatuse esimehe. Juhatuse esimees kutsub kokku ja juhatab juhatuse koosolekuid vastavalt vajadusele.
2022. aastal toimunud üldkoosolekul valiti 7-liikmeline juhatus:
Raido Roop, esimehe asetäitja
5330 0228
raido.roop@tallinnlv.ee
Tallinna Strateegiakeskus
Pille Metspalu
514 8308
pille@hendrikson.ee
Hendrikson & Ko OÜ
Kaie Enno
kaie.enno@gmail.com
Narva Linnavalitsus
Indrek Ranniku
511 0990
indrek.ranniku@tartu.ee
Tartu Linnavalitsus
Agnes Lihtsa
5819 0538
agnes.lihtsa@agri.ee
Regionaal- ja Põllumajandusministeerium